Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms