Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-1Q07627 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms