Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms