Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN12Q05209 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms