Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms