Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERCC6Q03468 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ERCC6Q03468 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms