Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN2Q02246 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN2Q02246 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms