Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF17Q02223 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms