Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UFM1P61960 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UFM1P61960 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UFM1P61960 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms