Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FAM3BP58499 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FAM3BP58499 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FAM3BP58499 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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