Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK1P57059 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK1P57059 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK1P57059 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIK1P57059 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIK1P57059 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIK1P57059 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms