Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms