Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FLT4P35916 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FLT4P35916 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FLT4P35916 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FLT4P35916 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FLT4P35916 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FLT4P35916 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FLT4P35916 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms