Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms