Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB2P29033 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB2P29033 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB2P29033 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms