Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms