Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRGP23470 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
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