Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGPD2P0DJD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms