Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C4AP0C0L4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms