Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCCAP05165 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCCAP05165 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCCAP05165 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms