Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD1O95696 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD1O95696 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms