Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALUO43852 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALUO43852 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALUO43852 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALUO43852 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALUO43852 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CALUO43852 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CALUO43852 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms