Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms