Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms