Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms