Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS37CA5D8V6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms