Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB4A4D0S4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB4A4D0S4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms