Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSC5DA1L4H1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSC5DA1L4H1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms