Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J276

TRAV25, T-cell receptor alpha variable 25 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV25A0A0B4J276 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAV25A0A0B4J276 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAV25A0A0B4J276 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAV25A0A0B4J276 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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