Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BBS9Q3SYG4 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms