Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCBQ16585 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms