Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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