Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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HERC1Q15751 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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HERC1Q15751 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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HERC1Q15751 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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HERC1Q15751 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERC1Q15751 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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