Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHBQ15464 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHBQ15464 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SHBQ15464 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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