Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms