Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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COL4A6Q14031 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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COL4A6Q14031 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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