Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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