Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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