Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCOF1Q13428 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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