Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms