Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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