Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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