Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC8.79□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC8.77□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
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