Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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