Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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