Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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HOXD10P28358 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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