Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms