Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms