Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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