Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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